MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cellulomonas flavigena DSM 20109 chromosome

Total Repeats: 125407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014151	CGT	2	6	106	111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
2	NC_014151	CGC	2	6	141	146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
3	NC_014151	CTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
4	NC_014151	TGC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
5	NC_014151	CGA	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
6	NC_014151	GCC	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
7	NC_014151	GTC	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
8	NC_014151	CCG	2	6	365	370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
9	NC_014151	CGT	2	6	393	398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
10	NC_014151	ACG	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
11	NC_014151	C	6	6	434	439	0 %	0 %	0 %	100 %	296127870
12	NC_014151	AGCGC	2	10	447	456	20 %	0 %	40 %	40 %	296127870
13	NC_014151	AGC	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
14	NC_014151	CGA	2	6	520	525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
15	NC_014151	CGC	2	6	529	534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
16	NC_014151	AGC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
17	NC_014151	TGCG	2	8	579	586	0 %	25 %	50 %	25 %	296127870
18	NC_014151	CTC	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296127870
19	NC_014151	ACG	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
20	NC_014151	ATC	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296127870
21	NC_014151	CGC	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
22	NC_014151	GTCGCG	2	12	716	727	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296127870
23	NC_014151	GTGCGC	2	12	839	850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296127870
24	NC_014151	GAG	2	6	863	868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127870
25	NC_014151	TCA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296127870
26	NC_014151	GGCG	2	8	907	914	0 %	0 %	75 %	25 %	296127870
27	NC_014151	CGA	2	6	955	960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
28	NC_014151	GGA	2	6	994	999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127870
29	NC_014151	TTC	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296127870
30	NC_014151	AGCA	2	8	1034	1041	50 %	0 %	25 %	25 %	296127870
31	NC_014151	GTC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127870
32	NC_014151	AGC	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
33	NC_014151	TCA	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296127870
34	NC_014151	GCC	2	6	1138	1143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127870
35	NC_014151	AAG	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296127870
36	NC_014151	GCG	2	6	1181	1186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127870
37	NC_014151	CGA	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
38	NC_014151	TCGCG	2	10	1227	1236	0 %	20 %	40 %	40 %	296127870
39	NC_014151	TCGC	2	8	1322	1329	0 %	25 %	25 %	50 %	296127870
40	NC_014151	CGA	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
41	NC_014151	CGA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
42	NC_014151	TCGA	2	8	1424	1431	25 %	25 %	25 %	25 %	296127870
43	NC_014151	CG	3	6	1455	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	296127870
44	NC_014151	CGG	2	6	1543	1548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127870
45	NC_014151	ACG	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
46	NC_014151	AGC	3	9	1653	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127870
47	NC_014151	TCGA	2	8	2439	2446	25 %	25 %	25 %	25 %	296127871
48	NC_014151	CGCA	2	8	2476	2483	25 %	0 %	25 %	50 %	296127871
49	NC_014151	CCGAC	2	10	2489	2498	20 %	0 %	20 %	60 %	296127871
50	NC_014151	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296127871
51	NC_014151	CG	3	6	2588	2593	0 %	0 %	50 %	50 %	296127871
52	NC_014151	CCG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127871
53	NC_014151	GAGC	2	8	2611	2618	25 %	0 %	50 %	25 %	296127871
54	NC_014151	GCT	2	6	2644	2649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
55	NC_014151	CGT	2	6	2689	2694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
56	NC_014151	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
57	NC_014151	ACGC	2	8	2825	2832	25 %	0 %	25 %	50 %	296127871
58	NC_014151	CGA	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127871
59	NC_014151	GCT	2	6	2878	2883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
60	NC_014151	GCGT	2	8	2889	2896	0 %	25 %	50 %	25 %	296127871
61	NC_014151	CGAC	2	8	2931	2938	25 %	0 %	25 %	50 %	296127871
62	NC_014151	CGG	3	9	3082	3090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127871
63	NC_014151	CGG	2	6	3115	3120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127871
64	NC_014151	ACC	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296127871
65	NC_014151	TCG	2	6	3141	3146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
66	NC_014151	CCCG	2	8	3157	3164	0 %	0 %	25 %	75 %	296127871
67	NC_014151	GCC	2	6	3168	3173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127871
68	NC_014151	GCC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127871
69	NC_014151	TCG	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
70	NC_014151	GTC	2	6	3299	3304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
71	NC_014151	CGA	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127871
72	NC_014151	CGA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127871
73	NC_014151	GC	3	6	3417	3422	0 %	0 %	50 %	50 %	296127871
74	NC_014151	CGA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127871
75	NC_014151	CTG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127871
76	NC_014151	GACCT	2	10	3550	3559	20 %	20 %	20 %	40 %	296127871
77	NC_014151	TGG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296127872
78	NC_014151	GCC	2	6	3704	3709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127872
79	NC_014151	CGG	2	6	3803	3808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
80	NC_014151	CTC	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296127872
81	NC_014151	CGG	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
82	NC_014151	TAC	2	6	3922	3927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296127872
83	NC_014151	TCG	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127872
84	NC_014151	CGG	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
85	NC_014151	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
86	NC_014151	CGC	2	6	4046	4051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127872
87	NC_014151	GC	3	6	4062	4067	0 %	0 %	50 %	50 %	296127872
88	NC_014151	TCC	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296127872
89	NC_014151	GC	3	6	4104	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	296127872
90	NC_014151	TGCG	2	8	4259	4266	0 %	25 %	50 %	25 %	296127872
91	NC_014151	GCT	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127872
92	NC_014151	CTG	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127872
93	NC_014151	CGA	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127872
94	NC_014151	CGA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127872
95	NC_014151	CGG	2	6	4433	4438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
96	NC_014151	GTT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296127872
97	NC_014151	CG	3	6	4446	4451	0 %	0 %	50 %	50 %	296127872
98	NC_014151	CAG	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127872
99	NC_014151	CGG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127872
100	NC_014151	GC	3	6	4530	4535	0 %	0 %	50 %	50 %	296127872
101	NC_014151	GGCG	2	8	4536	4543	0 %	0 %	75 %	25 %	296127872
102	NC_014151	TCG	2	6	4675	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
103	NC_014151	GGGCA	2	10	4689	4698	20 %	0 %	60 %	20 %	296127873
104	NC_014151	TCG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
105	NC_014151	CG	3	6	4791	4796	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
106	NC_014151	GC	3	6	4802	4807	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
107	NC_014151	GGT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296127873
108	NC_014151	GAG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127873
109	NC_014151	TCG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
110	NC_014151	CG	3	6	4876	4881	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
111	NC_014151	CGG	2	6	4886	4891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127873
112	NC_014151	GC	3	6	4905	4910	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
113	NC_014151	GGA	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127873
114	NC_014151	CGA	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127873
115	NC_014151	GCT	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
116	NC_014151	CGC	2	6	5023	5028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127873
117	NC_014151	TGC	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
118	NC_014151	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127873
119	NC_014151	GC	4	8	5112	5119	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
120	NC_014151	GTC	3	9	5181	5189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
121	NC_014151	TGC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
122	NC_014151	TC	3	6	5289	5294	0 %	50 %	0 %	50 %	296127873
123	NC_014151	CGC	2	6	5297	5302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127873
124	NC_014151	TCG	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
125	NC_014151	GC	3	6	5364	5369	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
126	NC_014151	CGA	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127873
127	NC_014151	CGG	2	6	5462	5467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127873
128	NC_014151	CGT	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127873
129	NC_014151	GAC	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127873
130	NC_014151	CGG	2	6	5581	5586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127873
131	NC_014151	GAC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127873
132	NC_014151	ACGC	2	8	5644	5651	25 %	0 %	25 %	50 %	296127873
133	NC_014151	CGC	3	9	5649	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127873
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135	NC_014151	GC	3	6	5745	5750	0 %	0 %	50 %	50 %	296127873
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142	NC_014151	CGG	2	6	5882	5887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127874
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261	NC_014151	CAA	2	6	9750	9755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296127876
262	NC_014151	TCG	2	6	9809	9814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127876
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264	NC_014151	CGA	2	6	9969	9974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
265	NC_014151	GAG	2	6	10009	10014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127876
266	NC_014151	CTC	2	6	10036	10041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296127876
267	NC_014151	CGA	2	6	10047	10052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
268	NC_014151	GCAGGC	2	12	10056	10067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296127876
269	NC_014151	GGC	2	6	10095	10100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127876
270	NC_014151	ACG	2	6	10130	10135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
271	NC_014151	GAG	2	6	10207	10212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296127876
272	NC_014151	GTC	2	6	10222	10227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127876
273	NC_014151	CGA	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
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277	NC_014151	CG	3	6	10328	10333	0 %	0 %	50 %	50 %	296127876
278	NC_014151	GGC	2	6	10384	10389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127876
279	NC_014151	GC	3	6	10403	10408	0 %	0 %	50 %	50 %	296127876
280	NC_014151	GAC	2	6	10420	10425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
281	NC_014151	CTT	2	6	10437	10442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296127876
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283	NC_014151	GCT	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127876
284	NC_014151	TTC	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296127876
285	NC_014151	GGCC	2	8	10524	10531	0 %	0 %	50 %	50 %	296127876
286	NC_014151	CTG	2	6	10561	10566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127876
287	NC_014151	CCA	2	6	10643	10648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296127876
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291	NC_014151	GGCC	2	8	10741	10748	0 %	0 %	50 %	50 %	296127876
292	NC_014151	CGA	2	6	10749	10754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
293	NC_014151	TCG	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127876
294	NC_014151	CGA	2	6	10839	10844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
295	NC_014151	CCA	2	6	10868	10873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296127876
296	NC_014151	GCG	2	6	10874	10879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127876
297	NC_014151	CGA	3	9	10902	10910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
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303	NC_014151	GAC	2	6	11098	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127876
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371	NC_014151	ACG	2	6	13738	13743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127880
372	NC_014151	GCC	2	6	13750	13755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127880
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377	NC_014151	GCG	2	6	13884	13889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127880
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380	NC_014151	GCT	2	6	13991	13996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127880
381	NC_014151	GTC	2	6	14007	14012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127880
382	NC_014151	GGC	2	6	14034	14039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296127880
383	NC_014151	GTC	2	6	14043	14048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127880
384	NC_014151	CG	3	6	14087	14092	0 %	0 %	50 %	50 %	296127880
385	NC_014151	GCA	2	6	14097	14102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296127880
386	NC_014151	GC	3	6	14103	14108	0 %	0 %	50 %	50 %	296127880
387	NC_014151	CG	3	6	14109	14114	0 %	0 %	50 %	50 %	296127880
388	NC_014151	CCGCG	2	10	14123	14132	0 %	0 %	40 %	60 %	296127880
389	NC_014151	TCC	2	6	14179	14184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296127880
390	NC_014151	GCT	2	6	14209	14214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127880
391	NC_014151	CCG	2	6	14239	14244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296127880
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393	NC_014151	CG	3	6	14268	14273	0 %	0 %	50 %	50 %	296127880
394	NC_014151	CTG	2	6	14283	14288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296127880
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500	NC_014151	GGT	2	6	19375	19380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296127885

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